腸内菌叢解析サービスとは?
私たちの身体(皮膚、口腔、消化器系などの様々な部位)には、膨大な数の常在細菌が生息していますが、特に大腸では、腸内細菌と呼ばれる多種多様な微生物が複雑な生態系を構築しており、この複雑な微生物群集は総称して腸内菌叢と呼ばれています。腸内細菌の多くは酸素を嫌うという特徴を持っているため、培養が難しく、これまでは腸内細菌種の同定ならびに機能特性について良く分かっていませんでした。しかしながら、近年では腸内菌叢の解析手法にメタゲノム解析1) を取り入れたことにより、腸内細菌種を培養することなく、腸内菌叢をゲノムレベルで網羅的に解析することが出来るようになりました。これにより、ヒト腸内菌叢における多く知見が蓄積されたことで、この腸内菌叢が大腸に関わる疾患だけでなく、肥満や糖尿病などの代謝性疾患、心疾患、がんなど様々な疾患に影響を及ぼしていることが明らかとなってきました。
NOSTERでは、細菌がもつ 16S rRNA 遺伝子をPCR にて増幅し、次世代シーケンサーで解析することで、検体に含まれる細菌の種類や分布を網羅的に評価することができます。さらに、NOSTERが保有する高度な培養技術をリアルタイムPCR解析と組み合わせることで、従来評価が困難であった各種腸内細菌の定量解析も可能にしました。
1)メタゲノム解析:「メタ」とは、「超越」を意味するメタ(meta-)に「ゲノム」を合成した言葉であり、微生物群集を培養することなく、そのままゲノムを精製して直接、シークエンスし、網羅的に解読、群集構造を明らかにする解析手法。
サービス概要
対象試料 |
ヒト、動物(マウス、ラットなど)の糞便 ※上記以外でも対応可能な場合があります。詳細はお問い合わせください。 |
作業内容 |
ゲノムDNA抽出/精製+PCR増幅+PCR産物の定量 +シーケンス解析+データ解析 |
納品物 |
一次解析(相同性解析)、生データ(Fastqファイル)、作業報告書 ※二次解析(多様性解析、統計解析等)はオプションとなります。 |
納 期 |
検体受領後、24営業日~ |
解析概要
解析オプション 二次解析
EzBioCloud 16S databaseを使用した菌種レベルまでの解析、多様性解析、統計解析など
定量オプション 定量解析
独自に確立した嫌気性細菌(Akkermansia, Bacteroides, Blautia, Clostridium etc.)の培養技術を利用することにより、糞便重量あたりの菌数を個別に定量解析することが可能です。本定量オプションは、メタ16S解析で見出された変化に、高いレベルでの定量的な情報を補完します。
Noster保有プライマーを用いたリアルタイムPCR解析による検体中の特定微生物の定量解析
1検体あたりの価格(税込)
メタボローム解析サービスと同時申し込み
腸内菌叢解析サービスのみのお申し込み
その他
メタボローム解析結果との相関解析も承ります。 価格33,000円/依頼
ご依頼から報告までの流れ
お客様の研究目的に応じた解析方法をご相談させていただきます。まずは、お気軽にお問い合わせください。
1.打ち合わせ
測定に必要な各種情報のご提供(研究目的、試料形態・量など)
2.試料輸送
宅配便による輸送(冷蔵・冷凍便) 着荷日は営業日(月〜金)でお願いします。
(試料発送時には、担当者までご連絡ください)
3.保管
お預かりした試料は、試料に適した条件で保管します。(冷蔵、冷凍あるいは極低温冷凍庫)
4.前処理
腸内菌叢解析の経験が豊富なスタッフが試料に応じた最適な前処理をします。
5.測定
各種分析機器を最高のコンディションで、最適なメソッドを用いて測定します。
6.解析・ご報告
ご依頼内容に応じて、相同性解析、バーチャート、オプション項目の結果などをご報告します。
解析に関する注意事項
- 得られた解析結果は研究目的にのみ利用可能です。診断などの他の目的にはご利用できません。
- 個人情報に関しては、解析依頼元で匿名化をお願いします。
- 病原性ウィルスによる汚染サンプルなど、感染の恐れがあるサンプルの受け入れは行っておりません。
- 解析データは解析終了後1年間保存します。保存期間終了後は消去します